Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1H8

Mrpl53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl53Q9D1H8 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl53Q9D1H8 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl53Q9D1H8 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl53Q9D1H8 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl53Q9D1H8 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl53Q9D1H8 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl53Q9D1H8 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl53Q9D1H8 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl53Q9D1H8 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl53Q9D1H8 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl53Q9D1H8 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl53Q9D1H8 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl53Q9D1H8 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl53Q9D1H8 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl53Q9D1H8 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl53Q9D1H8 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl53Q9D1H8 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl53Q9D1H8 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl53Q9D1H8 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl53Q9D1H8 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl53Q9D1H8 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl53Q9D1H8 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl53Q9D1H8 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl53Q9D1H8 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl53Q9D1H8 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl53Q9D1H8 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl53Q9D1H8 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl53Q9D1H8 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl53Q9D1H8 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl53Q9D1H8 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl53Q9D1H8 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl53Q9D1H8 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl53Q9D1H8 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl53Q9D1H8 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl53Q9D1H8 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mrpl53Q9D1H8 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl53Q9D1H8 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl53Q9D1H8 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl53Q9D1H8 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl53Q9D1H8 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl53Q9D1H8 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl53Q9D1H8 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl53Q9D1H8 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl53Q9D1H8 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl53Q9D1H8 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl53Q9D1H8 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl53Q9D1H8 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl53Q9D1H8 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl53Q9D1H8 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl53Q9D1H8 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl53Q9D1H8 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl53Q9D1H8 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl53Q9D1H8 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl53Q9D1H8 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl53Q9D1H8 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl53Q9D1H8 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl53Q9D1H8 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl53Q9D1H8 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl53Q9D1H8 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl53Q9D1H8 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl53Q9D1H8 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl53Q9D1H8 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl53Q9D1H8 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl53Q9D1H8 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl53Q9D1H8 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl53Q9D1H8 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl53Q9D1H8 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl53Q9D1H8 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl53Q9D1H8 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl53Q9D1H8 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl53Q9D1H8 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl53Q9D1H8 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl53Q9D1H8 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl53Q9D1H8 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl53Q9D1H8 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl53Q9D1H8 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl53Q9D1H8 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl53Q9D1H8 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mrpl53Q9D1H8 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mrpl53Q9D1H8 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mrpl53Q9D1H8 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mrpl53Q9D1H8 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mrpl53Q9D1H8 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mrpl53Q9D1H8 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mrpl53Q9D1H8 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mrpl53Q9D1H8 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mrpl53Q9D1H8 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mrpl53Q9D1H8 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mrpl53Q9D1H8 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Mrpl53Q9D1H8 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mrpl53Q9D1H8 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mrpl53Q9D1H8 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Mrpl53Q9D1H8 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mrpl53Q9D1H8 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Mrpl53Q9D1H8 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mrpl53Q9D1H8 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mrpl53Q9D1H8 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mrpl53Q9D1H8 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mrpl53Q9D1H8 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Mrpl53Q9D1H8 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms