Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms