Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYI0

Protein Njmu-R1, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CYI0 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Q9CYI0 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Q9CYI0 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Q9CYI0 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Q9CYI0 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Q9CYI0 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CYI0 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CYI0 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CYI0 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CYI0 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CYI0 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CYI0 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CYI0 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CYI0 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CYI0 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CYI0 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CYI0 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CYI0 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CYI0 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CYI0 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CYI0 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CYI0 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CYI0 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CYI0 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CYI0 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CYI0 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CYI0 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CYI0 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CYI0 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CYI0 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CYI0 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CYI0 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CYI0 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CYI0 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CYI0 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CYI0 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CYI0 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CYI0 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CYI0 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CYI0 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CYI0 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9CYI0 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9CYI0 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9CYI0 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9CYI0 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9CYI0 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9CYI0 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9CYI0 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9CYI0 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9CYI0 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9CYI0 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9CYI0 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9CYI0 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9CYI0 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9CYI0 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9CYI0 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9CYI0 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9CYI0 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9CYI0 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9CYI0 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9CYI0 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9CYI0 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CYI0 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CYI0 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CYI0 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CYI0 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CYI0 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CYI0 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CYI0 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CYI0 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CYI0 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CYI0 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CYI0 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CYI0 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CYI0 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CYI0 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CYI0 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CYI0 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CYI0 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CYI0 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CYI0 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CYI0 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CYI0 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CYI0 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CYI0 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CYI0 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CYI0 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CYI0 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CYI0 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CYI0 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CYI0 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CYI0 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CYI0 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CYI0 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CYI0 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CYI0 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CYI0 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CYI0 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CYI0 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CYI0 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms