Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYA6

Zcchc8, Zinc finger CCHC domain-containing protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc8Q9CYA6 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zcchc8Q9CYA6 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zcchc8Q9CYA6 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zcchc8Q9CYA6 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zcchc8Q9CYA6 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Zcchc8Q9CYA6 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zcchc8Q9CYA6 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zcchc8Q9CYA6 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zcchc8Q9CYA6 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zcchc8Q9CYA6 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zcchc8Q9CYA6 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zcchc8Q9CYA6 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zcchc8Q9CYA6 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zcchc8Q9CYA6 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zcchc8Q9CYA6 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zcchc8Q9CYA6 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zcchc8Q9CYA6 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zcchc8Q9CYA6 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zcchc8Q9CYA6 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zcchc8Q9CYA6 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zcchc8Q9CYA6 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zcchc8Q9CYA6 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zcchc8Q9CYA6 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zcchc8Q9CYA6 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zcchc8Q9CYA6 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zcchc8Q9CYA6 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zcchc8Q9CYA6 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zcchc8Q9CYA6 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zcchc8Q9CYA6 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zcchc8Q9CYA6 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zcchc8Q9CYA6 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zcchc8Q9CYA6 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zcchc8Q9CYA6 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zcchc8Q9CYA6 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zcchc8Q9CYA6 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zcchc8Q9CYA6 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zcchc8Q9CYA6 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Zcchc8Q9CYA6 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zcchc8Q9CYA6 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zcchc8Q9CYA6 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zcchc8Q9CYA6 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zcchc8Q9CYA6 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zcchc8Q9CYA6 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zcchc8Q9CYA6 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zcchc8Q9CYA6 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zcchc8Q9CYA6 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zcchc8Q9CYA6 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Zcchc8Q9CYA6 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zcchc8Q9CYA6 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zcchc8Q9CYA6 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zcchc8Q9CYA6 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zcchc8Q9CYA6 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Zcchc8Q9CYA6 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zcchc8Q9CYA6 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zcchc8Q9CYA6 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zcchc8Q9CYA6 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zcchc8Q9CYA6 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zcchc8Q9CYA6 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zcchc8Q9CYA6 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zcchc8Q9CYA6 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zcchc8Q9CYA6 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zcchc8Q9CYA6 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zcchc8Q9CYA6 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zcchc8Q9CYA6 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zcchc8Q9CYA6 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zcchc8Q9CYA6 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zcchc8Q9CYA6 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zcchc8Q9CYA6 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zcchc8Q9CYA6 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zcchc8Q9CYA6 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zcchc8Q9CYA6 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zcchc8Q9CYA6 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zcchc8Q9CYA6 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zcchc8Q9CYA6 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zcchc8Q9CYA6 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zcchc8Q9CYA6 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zcchc8Q9CYA6 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zcchc8Q9CYA6 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zcchc8Q9CYA6 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zcchc8Q9CYA6 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zcchc8Q9CYA6 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zcchc8Q9CYA6 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zcchc8Q9CYA6 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zcchc8Q9CYA6 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zcchc8Q9CYA6 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zcchc8Q9CYA6 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zcchc8Q9CYA6 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zcchc8Q9CYA6 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zcchc8Q9CYA6 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zcchc8Q9CYA6 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zcchc8Q9CYA6 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zcchc8Q9CYA6 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zcchc8Q9CYA6 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zcchc8Q9CYA6 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zcchc8Q9CYA6 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zcchc8Q9CYA6 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zcchc8Q9CYA6 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zcchc8Q9CYA6 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zcchc8Q9CYA6 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zcchc8Q9CYA6 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms