Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY57

Chtop, Chromatin target of PRMT1 protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChtopQ9CY57 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ChtopQ9CY57 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ChtopQ9CY57 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ChtopQ9CY57 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ChtopQ9CY57 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ChtopQ9CY57 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ChtopQ9CY57 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ChtopQ9CY57 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ChtopQ9CY57 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ChtopQ9CY57 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ChtopQ9CY57 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ChtopQ9CY57 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ChtopQ9CY57 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChtopQ9CY57 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChtopQ9CY57 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChtopQ9CY57 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChtopQ9CY57 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChtopQ9CY57 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChtopQ9CY57 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChtopQ9CY57 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChtopQ9CY57 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChtopQ9CY57 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChtopQ9CY57 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
ChtopQ9CY57 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChtopQ9CY57 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChtopQ9CY57 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChtopQ9CY57 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChtopQ9CY57 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
ChtopQ9CY57 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChtopQ9CY57 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChtopQ9CY57 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChtopQ9CY57 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChtopQ9CY57 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChtopQ9CY57 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChtopQ9CY57 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChtopQ9CY57 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChtopQ9CY57 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChtopQ9CY57 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChtopQ9CY57 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChtopQ9CY57 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChtopQ9CY57 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChtopQ9CY57 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChtopQ9CY57 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChtopQ9CY57 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChtopQ9CY57 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChtopQ9CY57 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChtopQ9CY57 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChtopQ9CY57 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChtopQ9CY57 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChtopQ9CY57 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChtopQ9CY57 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChtopQ9CY57 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChtopQ9CY57 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChtopQ9CY57 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChtopQ9CY57 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChtopQ9CY57 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChtopQ9CY57 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChtopQ9CY57 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ChtopQ9CY57 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ChtopQ9CY57 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ChtopQ9CY57 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ChtopQ9CY57 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ChtopQ9CY57 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ChtopQ9CY57 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ChtopQ9CY57 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
ChtopQ9CY57 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ChtopQ9CY57 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ChtopQ9CY57 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ChtopQ9CY57 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ChtopQ9CY57 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ChtopQ9CY57 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ChtopQ9CY57 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ChtopQ9CY57 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ChtopQ9CY57 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ChtopQ9CY57 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ChtopQ9CY57 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ChtopQ9CY57 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ChtopQ9CY57 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ChtopQ9CY57 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ChtopQ9CY57 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ChtopQ9CY57 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ChtopQ9CY57 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ChtopQ9CY57 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ChtopQ9CY57 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ChtopQ9CY57 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ChtopQ9CY57 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ChtopQ9CY57 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ChtopQ9CY57 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ChtopQ9CY57 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ChtopQ9CY57 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ChtopQ9CY57 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ChtopQ9CY57 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ChtopQ9CY57 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ChtopQ9CY57 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ChtopQ9CY57 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ChtopQ9CY57 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ChtopQ9CY57 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ChtopQ9CY57 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
ChtopQ9CY57 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ChtopQ9CY57 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms