Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXT8

Pmpcb, Mitochondrial-processing peptidase subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmpcbQ9CXT8 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PmpcbQ9CXT8 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PmpcbQ9CXT8 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PmpcbQ9CXT8 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PmpcbQ9CXT8 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PmpcbQ9CXT8 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PmpcbQ9CXT8 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PmpcbQ9CXT8 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PmpcbQ9CXT8 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PmpcbQ9CXT8 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PmpcbQ9CXT8 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PmpcbQ9CXT8 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PmpcbQ9CXT8 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PmpcbQ9CXT8 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PmpcbQ9CXT8 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms