Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pfdn1Q9CWM4 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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