Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUN6

Smurf1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, mousemouse

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Length 731 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf1Q9CUN6 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smurf1Q9CUN6 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smurf1Q9CUN6 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smurf1Q9CUN6 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smurf1Q9CUN6 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smurf1Q9CUN6 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smurf1Q9CUN6 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smurf1Q9CUN6 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Smurf1Q9CUN6 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smurf1Q9CUN6 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smurf1Q9CUN6 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smurf1Q9CUN6 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smurf1Q9CUN6 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smurf1Q9CUN6 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smurf1Q9CUN6 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smurf1Q9CUN6 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smurf1Q9CUN6 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smurf1Q9CUN6 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smurf1Q9CUN6 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smurf1Q9CUN6 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smurf1Q9CUN6 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smurf1Q9CUN6 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smurf1Q9CUN6 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smurf1Q9CUN6 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smurf1Q9CUN6 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smurf1Q9CUN6 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smurf1Q9CUN6 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smurf1Q9CUN6 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smurf1Q9CUN6 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smurf1Q9CUN6 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Smurf1Q9CUN6 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smurf1Q9CUN6 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smurf1Q9CUN6 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smurf1Q9CUN6 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Smurf1Q9CUN6 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smurf1Q9CUN6 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smurf1Q9CUN6 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smurf1Q9CUN6 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smurf1Q9CUN6 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smurf1Q9CUN6 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smurf1Q9CUN6 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smurf1Q9CUN6 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smurf1Q9CUN6 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smurf1Q9CUN6 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Smurf1Q9CUN6 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smurf1Q9CUN6 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smurf1Q9CUN6 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smurf1Q9CUN6 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smurf1Q9CUN6 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smurf1Q9CUN6 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smurf1Q9CUN6 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smurf1Q9CUN6 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smurf1Q9CUN6 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smurf1Q9CUN6 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smurf1Q9CUN6 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smurf1Q9CUN6 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smurf1Q9CUN6 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Smurf1Q9CUN6 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smurf1Q9CUN6 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smurf1Q9CUN6 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smurf1Q9CUN6 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smurf1Q9CUN6 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Smurf1Q9CUN6 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smurf1Q9CUN6 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Smurf1Q9CUN6 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smurf1Q9CUN6 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smurf1Q9CUN6 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smurf1Q9CUN6 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smurf1Q9CUN6 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smurf1Q9CUN6 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Smurf1Q9CUN6 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smurf1Q9CUN6 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Smurf1Q9CUN6 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smurf1Q9CUN6 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smurf1Q9CUN6 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smurf1Q9CUN6 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smurf1Q9CUN6 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smurf1Q9CUN6 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smurf1Q9CUN6 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smurf1Q9CUN6 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smurf1Q9CUN6 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smurf1Q9CUN6 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smurf1Q9CUN6 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smurf1Q9CUN6 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smurf1Q9CUN6 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smurf1Q9CUN6 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smurf1Q9CUN6 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smurf1Q9CUN6 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Smurf1Q9CUN6 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Smurf1Q9CUN6 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Smurf1Q9CUN6 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Smurf1Q9CUN6 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Smurf1Q9CUN6 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Smurf1Q9CUN6 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Smurf1Q9CUN6 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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