Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rdm1Q9CQK3 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rdm1Q9CQK3 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rdm1Q9CQK3 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rdm1Q9CQK3 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rdm1Q9CQK3 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rdm1Q9CQK3 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rdm1Q9CQK3 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rdm1Q9CQK3 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rdm1Q9CQK3 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rdm1Q9CQK3 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rdm1Q9CQK3 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rdm1Q9CQK3 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rdm1Q9CQK3 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rdm1Q9CQK3 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rdm1Q9CQK3 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rdm1Q9CQK3 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rdm1Q9CQK3 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rdm1Q9CQK3 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rdm1Q9CQK3 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rdm1Q9CQK3 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rdm1Q9CQK3 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rdm1Q9CQK3 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rdm1Q9CQK3 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rdm1Q9CQK3 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rdm1Q9CQK3 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rdm1Q9CQK3 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rdm1Q9CQK3 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rdm1Q9CQK3 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rdm1Q9CQK3 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rdm1Q9CQK3 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rdm1Q9CQK3 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rdm1Q9CQK3 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rdm1Q9CQK3 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rdm1Q9CQK3 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rdm1Q9CQK3 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rdm1Q9CQK3 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rdm1Q9CQK3 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rdm1Q9CQK3 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rdm1Q9CQK3 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rdm1Q9CQK3 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rdm1Q9CQK3 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rdm1Q9CQK3 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rdm1Q9CQK3 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rdm1Q9CQK3 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rdm1Q9CQK3 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rdm1Q9CQK3 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rdm1Q9CQK3 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rdm1Q9CQK3 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rdm1Q9CQK3 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rdm1Q9CQK3 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rdm1Q9CQK3 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Rdm1Q9CQK3 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rdm1Q9CQK3 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rdm1Q9CQK3 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rdm1Q9CQK3 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rdm1Q9CQK3 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Rdm1Q9CQK3 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rdm1Q9CQK3 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rdm1Q9CQK3 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rdm1Q9CQK3 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rdm1Q9CQK3 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rdm1Q9CQK3 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rdm1Q9CQK3 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rdm1Q9CQK3 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rdm1Q9CQK3 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rdm1Q9CQK3 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rdm1Q9CQK3 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rdm1Q9CQK3 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rdm1Q9CQK3 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rdm1Q9CQK3 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rdm1Q9CQK3 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rdm1Q9CQK3 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rdm1Q9CQK3 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rdm1Q9CQK3 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rdm1Q9CQK3 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rdm1Q9CQK3 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rdm1Q9CQK3 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Rdm1Q9CQK3 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rdm1Q9CQK3 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rdm1Q9CQK3 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rdm1Q9CQK3 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rdm1Q9CQK3 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rdm1Q9CQK3 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Rdm1Q9CQK3 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rdm1Q9CQK3 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rdm1Q9CQK3 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rdm1Q9CQK3 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rdm1Q9CQK3 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rdm1Q9CQK3 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rdm1Q9CQK3 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rdm1Q9CQK3 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rdm1Q9CQK3 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rdm1Q9CQK3 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rdm1Q9CQK3 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rdm1Q9CQK3 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rdm1Q9CQK3 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Rdm1Q9CQK3 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Rdm1Q9CQK3 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rdm1Q9CQK3 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
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