Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Rab5aQ9CQD1 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Rab5aQ9CQD1 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
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