Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CQC3 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CQC3 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CQC3 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CQC3 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CQC3 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CQC3 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CQC3 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CQC3 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms