Protein–RNA interactions for Protein: Q99NH8

Trem2, Triggering receptor expressed on myeloid cells 2, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem2Q99NH8 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trem2Q99NH8 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trem2Q99NH8 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trem2Q99NH8 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms