Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB8

Ubqln4, Ubiquilin-4, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln4Q99NB8 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Ubqln4Q99NB8 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubqln4Q99NB8 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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