Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE3

Lysmd3, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lysmd3Q99LE3 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lysmd3Q99LE3 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lysmd3Q99LE3 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lysmd3Q99LE3 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lysmd3Q99LE3 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lysmd3Q99LE3 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lysmd3Q99LE3 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lysmd3Q99LE3 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lysmd3Q99LE3 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lysmd3Q99LE3 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lysmd3Q99LE3 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lysmd3Q99LE3 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lysmd3Q99LE3 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lysmd3Q99LE3 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lysmd3Q99LE3 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lysmd3Q99LE3 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lysmd3Q99LE3 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lysmd3Q99LE3 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lysmd3Q99LE3 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lysmd3Q99LE3 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lysmd3Q99LE3 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lysmd3Q99LE3 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lysmd3Q99LE3 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lysmd3Q99LE3 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lysmd3Q99LE3 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lysmd3Q99LE3 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lysmd3Q99LE3 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lysmd3Q99LE3 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lysmd3Q99LE3 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lysmd3Q99LE3 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms