Protein–RNA interactions for Protein: Q924W5

Smc6, Structural maintenance of chromosomes protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,097 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc6Q924W5 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smc6Q924W5 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smc6Q924W5 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smc6Q924W5 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smc6Q924W5 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smc6Q924W5 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smc6Q924W5 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smc6Q924W5 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smc6Q924W5 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smc6Q924W5 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smc6Q924W5 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smc6Q924W5 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smc6Q924W5 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smc6Q924W5 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smc6Q924W5 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smc6Q924W5 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smc6Q924W5 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smc6Q924W5 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smc6Q924W5 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smc6Q924W5 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smc6Q924W5 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smc6Q924W5 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smc6Q924W5 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smc6Q924W5 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smc6Q924W5 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smc6Q924W5 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smc6Q924W5 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smc6Q924W5 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smc6Q924W5 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smc6Q924W5 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smc6Q924W5 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smc6Q924W5 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smc6Q924W5 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Smc6Q924W5 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smc6Q924W5 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smc6Q924W5 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smc6Q924W5 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smc6Q924W5 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smc6Q924W5 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smc6Q924W5 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Smc6Q924W5 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smc6Q924W5 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smc6Q924W5 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smc6Q924W5 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smc6Q924W5 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smc6Q924W5 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smc6Q924W5 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smc6Q924W5 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smc6Q924W5 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smc6Q924W5 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smc6Q924W5 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smc6Q924W5 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smc6Q924W5 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smc6Q924W5 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smc6Q924W5 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smc6Q924W5 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smc6Q924W5 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smc6Q924W5 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smc6Q924W5 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Smc6Q924W5 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smc6Q924W5 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smc6Q924W5 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smc6Q924W5 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smc6Q924W5 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smc6Q924W5 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smc6Q924W5 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smc6Q924W5 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smc6Q924W5 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Smc6Q924W5 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smc6Q924W5 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smc6Q924W5 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smc6Q924W5 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smc6Q924W5 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smc6Q924W5 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smc6Q924W5 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smc6Q924W5 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smc6Q924W5 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smc6Q924W5 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smc6Q924W5 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smc6Q924W5 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smc6Q924W5 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smc6Q924W5 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smc6Q924W5 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smc6Q924W5 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smc6Q924W5 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smc6Q924W5 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smc6Q924W5 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smc6Q924W5 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smc6Q924W5 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smc6Q924W5 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smc6Q924W5 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smc6Q924W5 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smc6Q924W5 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smc6Q924W5 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smc6Q924W5 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smc6Q924W5 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smc6Q924W5 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smc6Q924W5 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smc6Q924W5 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smc6Q924W5 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms