Protein–RNA interactions for Protein: Q923D4

Sf3b5, Splicing factor 3B subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b5Q923D4 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sf3b5Q923D4 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Sf3b5Q923D4 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sf3b5Q923D4 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Sf3b5Q923D4 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Sf3b5Q923D4 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Sf3b5Q923D4 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sf3b5Q923D4 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sf3b5Q923D4 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sf3b5Q923D4 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sf3b5Q923D4 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sf3b5Q923D4 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sf3b5Q923D4 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sf3b5Q923D4 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sf3b5Q923D4 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sf3b5Q923D4 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sf3b5Q923D4 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sf3b5Q923D4 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sf3b5Q923D4 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sf3b5Q923D4 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sf3b5Q923D4 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sf3b5Q923D4 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sf3b5Q923D4 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sf3b5Q923D4 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sf3b5Q923D4 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sf3b5Q923D4 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sf3b5Q923D4 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sf3b5Q923D4 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sf3b5Q923D4 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sf3b5Q923D4 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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