Protein–RNA interactions for Protein: Q922U1

Prpf3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf3Q922U1 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prpf3Q922U1 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.1 ms