Protein–RNA interactions for Protein: Q920N1

Odf3, Outer dense fiber protein 3, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf3Q920N1 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Odf3Q920N1 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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