Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ1

Pde6c, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6cQ91ZQ1 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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Pde6cQ91ZQ1 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde6cQ91ZQ1 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Pde6cQ91ZQ1 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Pde6cQ91ZQ1 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde6cQ91ZQ1 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Pde6cQ91ZQ1 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Pde6cQ91ZQ1 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde6cQ91ZQ1 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde6cQ91ZQ1 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Pde6cQ91ZQ1 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Pde6cQ91ZQ1 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde6cQ91ZQ1 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Pde6cQ91ZQ1 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
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Pde6cQ91ZQ1 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Pde6cQ91ZQ1 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Pde6cQ91ZQ1 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pde6cQ91ZQ1 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Pde6cQ91ZQ1 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pde6cQ91ZQ1 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pde6cQ91ZQ1 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Pde6cQ91ZQ1 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Pde6cQ91ZQ1 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pde6cQ91ZQ1 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Pde6cQ91ZQ1 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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