Protein–RNA interactions for Protein: Q91YR7

Prpf6, Pre-mRNA-processing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf6Q91YR7 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prpf6Q91YR7 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prpf6Q91YR7 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prpf6Q91YR7 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prpf6Q91YR7 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prpf6Q91YR7 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prpf6Q91YR7 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prpf6Q91YR7 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prpf6Q91YR7 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prpf6Q91YR7 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prpf6Q91YR7 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prpf6Q91YR7 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prpf6Q91YR7 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prpf6Q91YR7 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prpf6Q91YR7 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prpf6Q91YR7 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prpf6Q91YR7 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prpf6Q91YR7 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prpf6Q91YR7 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prpf6Q91YR7 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prpf6Q91YR7 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prpf6Q91YR7 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prpf6Q91YR7 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prpf6Q91YR7 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prpf6Q91YR7 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prpf6Q91YR7 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prpf6Q91YR7 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prpf6Q91YR7 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prpf6Q91YR7 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prpf6Q91YR7 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prpf6Q91YR7 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prpf6Q91YR7 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prpf6Q91YR7 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prpf6Q91YR7 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prpf6Q91YR7 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prpf6Q91YR7 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prpf6Q91YR7 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Prpf6Q91YR7 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prpf6Q91YR7 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prpf6Q91YR7 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prpf6Q91YR7 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prpf6Q91YR7 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prpf6Q91YR7 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prpf6Q91YR7 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Prpf6Q91YR7 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Prpf6Q91YR7 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prpf6Q91YR7 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prpf6Q91YR7 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prpf6Q91YR7 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prpf6Q91YR7 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prpf6Q91YR7 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prpf6Q91YR7 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prpf6Q91YR7 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prpf6Q91YR7 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prpf6Q91YR7 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prpf6Q91YR7 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prpf6Q91YR7 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prpf6Q91YR7 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Prpf6Q91YR7 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prpf6Q91YR7 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prpf6Q91YR7 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prpf6Q91YR7 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prpf6Q91YR7 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prpf6Q91YR7 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prpf6Q91YR7 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prpf6Q91YR7 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prpf6Q91YR7 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prpf6Q91YR7 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Prpf6Q91YR7 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prpf6Q91YR7 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prpf6Q91YR7 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prpf6Q91YR7 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prpf6Q91YR7 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prpf6Q91YR7 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prpf6Q91YR7 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prpf6Q91YR7 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prpf6Q91YR7 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prpf6Q91YR7 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prpf6Q91YR7 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prpf6Q91YR7 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prpf6Q91YR7 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prpf6Q91YR7 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prpf6Q91YR7 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prpf6Q91YR7 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prpf6Q91YR7 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prpf6Q91YR7 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prpf6Q91YR7 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prpf6Q91YR7 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Prpf6Q91YR7 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prpf6Q91YR7 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prpf6Q91YR7 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prpf6Q91YR7 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prpf6Q91YR7 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prpf6Q91YR7 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prpf6Q91YR7 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prpf6Q91YR7 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prpf6Q91YR7 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prpf6Q91YR7 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prpf6Q91YR7 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prpf6Q91YR7 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms