Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atl3Q91YH5 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms