Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y07

Pcdhb12, MCG141300, mousemouse

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhb12Q91Y07 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcdhb12Q91Y07 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcdhb12Q91Y07 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcdhb12Q91Y07 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcdhb12Q91Y07 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcdhb12Q91Y07 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcdhb12Q91Y07 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcdhb12Q91Y07 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcdhb12Q91Y07 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcdhb12Q91Y07 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcdhb12Q91Y07 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcdhb12Q91Y07 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcdhb12Q91Y07 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcdhb12Q91Y07 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcdhb12Q91Y07 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcdhb12Q91Y07 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcdhb12Q91Y07 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcdhb12Q91Y07 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcdhb12Q91Y07 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcdhb12Q91Y07 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcdhb12Q91Y07 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcdhb12Q91Y07 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcdhb12Q91Y07 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcdhb12Q91Y07 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcdhb12Q91Y07 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcdhb12Q91Y07 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcdhb12Q91Y07 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcdhb12Q91Y07 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcdhb12Q91Y07 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcdhb12Q91Y07 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcdhb12Q91Y07 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcdhb12Q91Y07 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcdhb12Q91Y07 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcdhb12Q91Y07 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcdhb12Q91Y07 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcdhb12Q91Y07 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcdhb12Q91Y07 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcdhb12Q91Y07 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcdhb12Q91Y07 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pcdhb12Q91Y07 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pcdhb12Q91Y07 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pcdhb12Q91Y07 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pcdhb12Q91Y07 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pcdhb12Q91Y07 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pcdhb12Q91Y07 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pcdhb12Q91Y07 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pcdhb12Q91Y07 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pcdhb12Q91Y07 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pcdhb12Q91Y07 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pcdhb12Q91Y07 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pcdhb12Q91Y07 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pcdhb12Q91Y07 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pcdhb12Q91Y07 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pcdhb12Q91Y07 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pcdhb12Q91Y07 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pcdhb12Q91Y07 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pcdhb12Q91Y07 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pcdhb12Q91Y07 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pcdhb12Q91Y07 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pcdhb12Q91Y07 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pcdhb12Q91Y07 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pcdhb12Q91Y07 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pcdhb12Q91Y07 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pcdhb12Q91Y07 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pcdhb12Q91Y07 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pcdhb12Q91Y07 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pcdhb12Q91Y07 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pcdhb12Q91Y07 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pcdhb12Q91Y07 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pcdhb12Q91Y07 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pcdhb12Q91Y07 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pcdhb12Q91Y07 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pcdhb12Q91Y07 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pcdhb12Q91Y07 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pcdhb12Q91Y07 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pcdhb12Q91Y07 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pcdhb12Q91Y07 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pcdhb12Q91Y07 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pcdhb12Q91Y07 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pcdhb12Q91Y07 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pcdhb12Q91Y07 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pcdhb12Q91Y07 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pcdhb12Q91Y07 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pcdhb12Q91Y07 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pcdhb12Q91Y07 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pcdhb12Q91Y07 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pcdhb12Q91Y07 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pcdhb12Q91Y07 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pcdhb12Q91Y07 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pcdhb12Q91Y07 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pcdhb12Q91Y07 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pcdhb12Q91Y07 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pcdhb12Q91Y07 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pcdhb12Q91Y07 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pcdhb12Q91Y07 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pcdhb12Q91Y07 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pcdhb12Q91Y07 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pcdhb12Q91Y07 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pcdhb12Q91Y07 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pcdhb12Q91Y07 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms