Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ppargc1bQ8VHJ7 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ppargc1bQ8VHJ7 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ppargc1bQ8VHJ7 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ppargc1bQ8VHJ7 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ppargc1bQ8VHJ7 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr1281-201ENSMUST00000090326 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ppargc1bQ8VHJ7 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ppargc1bQ8VHJ7 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm37857-201ENSMUST00000191784 1199 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ppargc1bQ8VHJ7 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ppargc1bQ8VHJ7 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 1700120G11Rik-201ENSMUST00000150273 491 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms