Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD72

Ttc8, Tetratricopeptide repeat protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc8Q8VD72 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttc8Q8VD72 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttc8Q8VD72 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttc8Q8VD72 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttc8Q8VD72 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttc8Q8VD72 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttc8Q8VD72 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttc8Q8VD72 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttc8Q8VD72 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttc8Q8VD72 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttc8Q8VD72 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttc8Q8VD72 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttc8Q8VD72 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttc8Q8VD72 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttc8Q8VD72 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttc8Q8VD72 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttc8Q8VD72 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttc8Q8VD72 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttc8Q8VD72 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttc8Q8VD72 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttc8Q8VD72 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttc8Q8VD72 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttc8Q8VD72 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttc8Q8VD72 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttc8Q8VD72 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttc8Q8VD72 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttc8Q8VD72 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttc8Q8VD72 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttc8Q8VD72 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ttc8Q8VD72 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ttc8Q8VD72 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ttc8Q8VD72 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ttc8Q8VD72 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ttc8Q8VD72 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ttc8Q8VD72 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc8Q8VD72 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc8Q8VD72 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc8Q8VD72 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc8Q8VD72 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc8Q8VD72 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc8Q8VD72 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc8Q8VD72 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc8Q8VD72 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc8Q8VD72 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc8Q8VD72 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc8Q8VD72 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc8Q8VD72 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc8Q8VD72 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc8Q8VD72 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc8Q8VD72 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc8Q8VD72 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc8Q8VD72 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc8Q8VD72 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc8Q8VD72 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc8Q8VD72 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc8Q8VD72 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc8Q8VD72 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc8Q8VD72 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc8Q8VD72 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc8Q8VD72 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc8Q8VD72 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc8Q8VD72 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc8Q8VD72 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc8Q8VD72 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc8Q8VD72 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc8Q8VD72 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc8Q8VD72 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc8Q8VD72 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc8Q8VD72 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc8Q8VD72 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc8Q8VD72 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc8Q8VD72 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc8Q8VD72 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc8Q8VD72 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc8Q8VD72 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc8Q8VD72 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc8Q8VD72 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc8Q8VD72 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc8Q8VD72 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc8Q8VD72 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc8Q8VD72 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc8Q8VD72 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc8Q8VD72 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc8Q8VD72 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc8Q8VD72 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc8Q8VD72 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc8Q8VD72 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc8Q8VD72 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc8Q8VD72 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc8Q8VD72 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc8Q8VD72 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc8Q8VD72 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc8Q8VD72 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc8Q8VD72 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc8Q8VD72 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc8Q8VD72 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc8Q8VD72 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc8Q8VD72 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc8Q8VD72 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc8Q8VD72 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms