Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD62

Bles03, UPF0696 protein C11orf68 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bles03Q8VD62 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Bles03Q8VD62 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Bles03Q8VD62 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Bles03Q8VD62 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Bles03Q8VD62 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Bles03Q8VD62 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Bles03Q8VD62 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Bles03Q8VD62 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Bles03Q8VD62 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Bles03Q8VD62 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Bles03Q8VD62 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Bles03Q8VD62 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Bles03Q8VD62 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Bles03Q8VD62 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Bles03Q8VD62 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Bles03Q8VD62 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Bles03Q8VD62 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Bles03Q8VD62 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Bles03Q8VD62 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Bles03Q8VD62 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Bles03Q8VD62 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Bles03Q8VD62 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Bles03Q8VD62 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Bles03Q8VD62 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Bles03Q8VD62 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Bles03Q8VD62 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Bles03Q8VD62 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Bles03Q8VD62 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Bles03Q8VD62 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Bles03Q8VD62 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Bles03Q8VD62 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Bles03Q8VD62 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Bles03Q8VD62 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Bles03Q8VD62 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Bles03Q8VD62 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Bles03Q8VD62 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Bles03Q8VD62 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Bles03Q8VD62 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Bles03Q8VD62 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Bles03Q8VD62 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Bles03Q8VD62 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Bles03Q8VD62 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Bles03Q8VD62 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Bles03Q8VD62 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Bles03Q8VD62 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Bles03Q8VD62 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Bles03Q8VD62 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Bles03Q8VD62 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Bles03Q8VD62 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Bles03Q8VD62 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Bles03Q8VD62 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Bles03Q8VD62 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Bles03Q8VD62 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Bles03Q8VD62 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Bles03Q8VD62 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Bles03Q8VD62 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Bles03Q8VD62 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Bles03Q8VD62 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Bles03Q8VD62 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Bles03Q8VD62 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Bles03Q8VD62 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Bles03Q8VD62 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Bles03Q8VD62 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Bles03Q8VD62 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Bles03Q8VD62 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Bles03Q8VD62 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Bles03Q8VD62 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Bles03Q8VD62 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Bles03Q8VD62 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Bles03Q8VD62 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Bles03Q8VD62 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Bles03Q8VD62 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Bles03Q8VD62 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Bles03Q8VD62 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Bles03Q8VD62 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Bles03Q8VD62 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Bles03Q8VD62 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Bles03Q8VD62 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Bles03Q8VD62 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Bles03Q8VD62 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Bles03Q8VD62 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Bles03Q8VD62 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Bles03Q8VD62 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Bles03Q8VD62 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Bles03Q8VD62 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Bles03Q8VD62 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Bles03Q8VD62 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Bles03Q8VD62 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Bles03Q8VD62 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Bles03Q8VD62 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Bles03Q8VD62 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Bles03Q8VD62 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Bles03Q8VD62 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Bles03Q8VD62 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Bles03Q8VD62 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Bles03Q8VD62 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Bles03Q8VD62 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Bles03Q8VD62 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Bles03Q8VD62 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Bles03Q8VD62 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms