Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2C9

Hacd3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd3Q8K2C9 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hacd3Q8K2C9 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hacd3Q8K2C9 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hacd3Q8K2C9 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hacd3Q8K2C9 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hacd3Q8K2C9 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hacd3Q8K2C9 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hacd3Q8K2C9 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hacd3Q8K2C9 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hacd3Q8K2C9 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hacd3Q8K2C9 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hacd3Q8K2C9 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hacd3Q8K2C9 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hacd3Q8K2C9 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hacd3Q8K2C9 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hacd3Q8K2C9 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hacd3Q8K2C9 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hacd3Q8K2C9 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hacd3Q8K2C9 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hacd3Q8K2C9 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hacd3Q8K2C9 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hacd3Q8K2C9 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hacd3Q8K2C9 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Hacd3Q8K2C9 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hacd3Q8K2C9 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hacd3Q8K2C9 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hacd3Q8K2C9 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hacd3Q8K2C9 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hacd3Q8K2C9 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hacd3Q8K2C9 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hacd3Q8K2C9 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hacd3Q8K2C9 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hacd3Q8K2C9 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hacd3Q8K2C9 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hacd3Q8K2C9 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hacd3Q8K2C9 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hacd3Q8K2C9 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hacd3Q8K2C9 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Hacd3Q8K2C9 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hacd3Q8K2C9 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hacd3Q8K2C9 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hacd3Q8K2C9 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hacd3Q8K2C9 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hacd3Q8K2C9 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Hacd3Q8K2C9 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Hacd3Q8K2C9 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hacd3Q8K2C9 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hacd3Q8K2C9 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hacd3Q8K2C9 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hacd3Q8K2C9 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hacd3Q8K2C9 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hacd3Q8K2C9 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Hacd3Q8K2C9 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hacd3Q8K2C9 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hacd3Q8K2C9 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Hacd3Q8K2C9 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hacd3Q8K2C9 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hacd3Q8K2C9 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hacd3Q8K2C9 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hacd3Q8K2C9 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hacd3Q8K2C9 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hacd3Q8K2C9 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hacd3Q8K2C9 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hacd3Q8K2C9 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hacd3Q8K2C9 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hacd3Q8K2C9 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hacd3Q8K2C9 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hacd3Q8K2C9 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hacd3Q8K2C9 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hacd3Q8K2C9 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hacd3Q8K2C9 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hacd3Q8K2C9 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hacd3Q8K2C9 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hacd3Q8K2C9 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hacd3Q8K2C9 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hacd3Q8K2C9 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hacd3Q8K2C9 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Hacd3Q8K2C9 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hacd3Q8K2C9 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hacd3Q8K2C9 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hacd3Q8K2C9 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hacd3Q8K2C9 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hacd3Q8K2C9 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Hacd3Q8K2C9 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hacd3Q8K2C9 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hacd3Q8K2C9 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hacd3Q8K2C9 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hacd3Q8K2C9 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hacd3Q8K2C9 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hacd3Q8K2C9 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hacd3Q8K2C9 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hacd3Q8K2C9 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hacd3Q8K2C9 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hacd3Q8K2C9 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hacd3Q8K2C9 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hacd3Q8K2C9 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hacd3Q8K2C9 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hacd3Q8K2C9 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hacd3Q8K2C9 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hacd3Q8K2C9 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms