Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZP2

Syn3, Synapsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syn3Q8JZP2 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syn3Q8JZP2 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syn3Q8JZP2 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Syn3Q8JZP2 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Syn3Q8JZP2 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syn3Q8JZP2 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Syn3Q8JZP2 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syn3Q8JZP2 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syn3Q8JZP2 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syn3Q8JZP2 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syn3Q8JZP2 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syn3Q8JZP2 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syn3Q8JZP2 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Syn3Q8JZP2 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syn3Q8JZP2 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syn3Q8JZP2 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syn3Q8JZP2 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syn3Q8JZP2 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syn3Q8JZP2 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syn3Q8JZP2 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syn3Q8JZP2 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syn3Q8JZP2 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syn3Q8JZP2 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syn3Q8JZP2 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syn3Q8JZP2 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syn3Q8JZP2 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syn3Q8JZP2 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syn3Q8JZP2 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Syn3Q8JZP2 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Syn3Q8JZP2 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syn3Q8JZP2 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syn3Q8JZP2 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syn3Q8JZP2 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syn3Q8JZP2 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syn3Q8JZP2 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syn3Q8JZP2 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syn3Q8JZP2 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syn3Q8JZP2 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syn3Q8JZP2 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syn3Q8JZP2 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syn3Q8JZP2 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syn3Q8JZP2 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syn3Q8JZP2 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syn3Q8JZP2 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syn3Q8JZP2 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syn3Q8JZP2 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syn3Q8JZP2 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syn3Q8JZP2 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syn3Q8JZP2 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syn3Q8JZP2 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syn3Q8JZP2 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syn3Q8JZP2 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syn3Q8JZP2 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syn3Q8JZP2 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syn3Q8JZP2 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syn3Q8JZP2 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syn3Q8JZP2 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syn3Q8JZP2 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syn3Q8JZP2 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syn3Q8JZP2 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syn3Q8JZP2 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syn3Q8JZP2 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syn3Q8JZP2 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Syn3Q8JZP2 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syn3Q8JZP2 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syn3Q8JZP2 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syn3Q8JZP2 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syn3Q8JZP2 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syn3Q8JZP2 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syn3Q8JZP2 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syn3Q8JZP2 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syn3Q8JZP2 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syn3Q8JZP2 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Syn3Q8JZP2 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Syn3Q8JZP2 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Syn3Q8JZP2 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Syn3Q8JZP2 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syn3Q8JZP2 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syn3Q8JZP2 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syn3Q8JZP2 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syn3Q8JZP2 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syn3Q8JZP2 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syn3Q8JZP2 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syn3Q8JZP2 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syn3Q8JZP2 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syn3Q8JZP2 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syn3Q8JZP2 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syn3Q8JZP2 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syn3Q8JZP2 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syn3Q8JZP2 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Syn3Q8JZP2 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syn3Q8JZP2 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syn3Q8JZP2 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syn3Q8JZP2 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syn3Q8JZP2 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Syn3Q8JZP2 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syn3Q8JZP2 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Syn3Q8JZP2 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syn3Q8JZP2 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syn3Q8JZP2 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms