Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Usp27Q8CEG8 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
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Usp27Q8CEG8 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Usp27Q8CEG8 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Usp27Q8CEG8 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Usp27Q8CEG8 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp27Q8CEG8 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp27Q8CEG8 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp27Q8CEG8 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp27Q8CEG8 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp27Q8CEG8 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp27Q8CEG8 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
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Usp27Q8CEG8 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp27Q8CEG8 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
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