Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBY1

Samd4a, Protein Smaug homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd4aQ8CBY1 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Samd4aQ8CBY1 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Samd4aQ8CBY1 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Samd4aQ8CBY1 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Samd4aQ8CBY1 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Samd4aQ8CBY1 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Samd4aQ8CBY1 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Samd4aQ8CBY1 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Samd4aQ8CBY1 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Samd4aQ8CBY1 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Samd4aQ8CBY1 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Samd4aQ8CBY1 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Samd4aQ8CBY1 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Samd4aQ8CBY1 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Samd4aQ8CBY1 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Samd4aQ8CBY1 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Samd4aQ8CBY1 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Samd4aQ8CBY1 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Samd4aQ8CBY1 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Samd4aQ8CBY1 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Samd4aQ8CBY1 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Samd4aQ8CBY1 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Samd4aQ8CBY1 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Samd4aQ8CBY1 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Samd4aQ8CBY1 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Samd4aQ8CBY1 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Samd4aQ8CBY1 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Samd4aQ8CBY1 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Samd4aQ8CBY1 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Samd4aQ8CBY1 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Samd4aQ8CBY1 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Samd4aQ8CBY1 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Samd4aQ8CBY1 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Samd4aQ8CBY1 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Samd4aQ8CBY1 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Samd4aQ8CBY1 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Samd4aQ8CBY1 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Samd4aQ8CBY1 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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