Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6K9

Col6a6, Collagen alpha-6(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,265 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a6Q8C6K9 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Col6a6Q8C6K9 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Col6a6Q8C6K9 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Col6a6Q8C6K9 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms