Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5L3

Cnot2, CCR4-NOT transcription complex subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot2Q8C5L3 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnot2Q8C5L3 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnot2Q8C5L3 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnot2Q8C5L3 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cnot2Q8C5L3 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cnot2Q8C5L3 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cnot2Q8C5L3 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cnot2Q8C5L3 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cnot2Q8C5L3 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cnot2Q8C5L3 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cnot2Q8C5L3 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cnot2Q8C5L3 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cnot2Q8C5L3 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cnot2Q8C5L3 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cnot2Q8C5L3 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cnot2Q8C5L3 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cnot2Q8C5L3 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cnot2Q8C5L3 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cnot2Q8C5L3 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cnot2Q8C5L3 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cnot2Q8C5L3 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cnot2Q8C5L3 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cnot2Q8C5L3 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cnot2Q8C5L3 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cnot2Q8C5L3 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cnot2Q8C5L3 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cnot2Q8C5L3 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cnot2Q8C5L3 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cnot2Q8C5L3 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cnot2Q8C5L3 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cnot2Q8C5L3 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cnot2Q8C5L3 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cnot2Q8C5L3 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cnot2Q8C5L3 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cnot2Q8C5L3 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cnot2Q8C5L3 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cnot2Q8C5L3 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cnot2Q8C5L3 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cnot2Q8C5L3 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Cnot2Q8C5L3 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cnot2Q8C5L3 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cnot2Q8C5L3 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cnot2Q8C5L3 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cnot2Q8C5L3 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cnot2Q8C5L3 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cnot2Q8C5L3 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cnot2Q8C5L3 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cnot2Q8C5L3 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cnot2Q8C5L3 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cnot2Q8C5L3 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cnot2Q8C5L3 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cnot2Q8C5L3 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cnot2Q8C5L3 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cnot2Q8C5L3 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cnot2Q8C5L3 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cnot2Q8C5L3 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cnot2Q8C5L3 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cnot2Q8C5L3 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cnot2Q8C5L3 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cnot2Q8C5L3 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cnot2Q8C5L3 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cnot2Q8C5L3 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cnot2Q8C5L3 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cnot2Q8C5L3 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cnot2Q8C5L3 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cnot2Q8C5L3 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cnot2Q8C5L3 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cnot2Q8C5L3 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnot2Q8C5L3 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnot2Q8C5L3 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnot2Q8C5L3 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnot2Q8C5L3 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnot2Q8C5L3 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnot2Q8C5L3 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnot2Q8C5L3 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnot2Q8C5L3 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnot2Q8C5L3 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnot2Q8C5L3 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnot2Q8C5L3 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnot2Q8C5L3 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnot2Q8C5L3 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnot2Q8C5L3 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnot2Q8C5L3 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnot2Q8C5L3 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnot2Q8C5L3 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnot2Q8C5L3 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnot2Q8C5L3 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnot2Q8C5L3 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnot2Q8C5L3 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnot2Q8C5L3 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnot2Q8C5L3 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnot2Q8C5L3 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnot2Q8C5L3 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnot2Q8C5L3 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnot2Q8C5L3 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnot2Q8C5L3 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnot2Q8C5L3 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnot2Q8C5L3 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnot2Q8C5L3 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnot2Q8C5L3 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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