Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4D8

Gm11541, Predicted gene 11541, mousemouse

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Length 108 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11541Q8C4D8 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm11541Q8C4D8 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm11541Q8C4D8 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm11541Q8C4D8 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm11541Q8C4D8 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm11541Q8C4D8 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm11541Q8C4D8 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm11541Q8C4D8 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm11541Q8C4D8 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm11541Q8C4D8 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm11541Q8C4D8 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm11541Q8C4D8 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm11541Q8C4D8 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm11541Q8C4D8 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm11541Q8C4D8 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm11541Q8C4D8 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm11541Q8C4D8 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm11541Q8C4D8 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm11541Q8C4D8 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm11541Q8C4D8 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm11541Q8C4D8 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm11541Q8C4D8 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm11541Q8C4D8 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm11541Q8C4D8 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm11541Q8C4D8 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm11541Q8C4D8 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm11541Q8C4D8 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm11541Q8C4D8 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm11541Q8C4D8 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm11541Q8C4D8 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm11541Q8C4D8 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm11541Q8C4D8 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm11541Q8C4D8 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm11541Q8C4D8 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm11541Q8C4D8 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm11541Q8C4D8 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm11541Q8C4D8 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm11541Q8C4D8 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm11541Q8C4D8 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm11541Q8C4D8 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm11541Q8C4D8 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm11541Q8C4D8 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm11541Q8C4D8 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm11541Q8C4D8 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm11541Q8C4D8 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm11541Q8C4D8 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm11541Q8C4D8 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm11541Q8C4D8 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm11541Q8C4D8 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm11541Q8C4D8 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm11541Q8C4D8 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm11541Q8C4D8 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm11541Q8C4D8 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm11541Q8C4D8 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm11541Q8C4D8 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm11541Q8C4D8 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm11541Q8C4D8 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm11541Q8C4D8 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm11541Q8C4D8 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm11541Q8C4D8 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm11541Q8C4D8 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm11541Q8C4D8 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm11541Q8C4D8 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm11541Q8C4D8 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm11541Q8C4D8 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm11541Q8C4D8 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm11541Q8C4D8 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm11541Q8C4D8 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm11541Q8C4D8 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm11541Q8C4D8 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm11541Q8C4D8 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm11541Q8C4D8 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm11541Q8C4D8 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm11541Q8C4D8 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm11541Q8C4D8 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm11541Q8C4D8 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm11541Q8C4D8 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm11541Q8C4D8 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm11541Q8C4D8 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm11541Q8C4D8 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm11541Q8C4D8 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm11541Q8C4D8 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm11541Q8C4D8 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm11541Q8C4D8 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm11541Q8C4D8 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm11541Q8C4D8 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm11541Q8C4D8 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm11541Q8C4D8 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm11541Q8C4D8 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm11541Q8C4D8 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm11541Q8C4D8 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm11541Q8C4D8 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm11541Q8C4D8 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm11541Q8C4D8 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm11541Q8C4D8 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm11541Q8C4D8 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm11541Q8C4D8 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm11541Q8C4D8 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm11541Q8C4D8 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm11541Q8C4D8 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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