Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

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Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Atg16l1Q8C0J2 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg16l1Q8C0J2 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg16l1Q8C0J2 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg16l1Q8C0J2 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg16l1Q8C0J2 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg16l1Q8C0J2 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg16l1Q8C0J2 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg16l1Q8C0J2 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Atg16l1Q8C0J2 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg16l1Q8C0J2 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg16l1Q8C0J2 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg16l1Q8C0J2 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Atg16l1Q8C0J2 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Atg16l1Q8C0J2 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Atg16l1Q8C0J2 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Atg16l1Q8C0J2 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg16l1Q8C0J2 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Atg16l1Q8C0J2 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg16l1Q8C0J2 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Atg16l1Q8C0J2 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Atg16l1Q8C0J2 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg16l1Q8C0J2 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Atg16l1Q8C0J2 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg16l1Q8C0J2 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Atg16l1Q8C0J2 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg16l1Q8C0J2 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg16l1Q8C0J2 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg16l1Q8C0J2 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg16l1Q8C0J2 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg16l1Q8C0J2 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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