Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0D0

Trub1, Probable tRNA pseudouridine synthase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trub1Q8C0D0 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trub1Q8C0D0 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trub1Q8C0D0 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trub1Q8C0D0 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trub1Q8C0D0 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trub1Q8C0D0 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trub1Q8C0D0 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trub1Q8C0D0 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trub1Q8C0D0 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trub1Q8C0D0 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trub1Q8C0D0 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trub1Q8C0D0 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trub1Q8C0D0 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trub1Q8C0D0 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trub1Q8C0D0 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trub1Q8C0D0 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trub1Q8C0D0 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trub1Q8C0D0 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trub1Q8C0D0 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trub1Q8C0D0 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trub1Q8C0D0 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trub1Q8C0D0 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trub1Q8C0D0 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trub1Q8C0D0 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trub1Q8C0D0 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trub1Q8C0D0 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trub1Q8C0D0 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trub1Q8C0D0 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trub1Q8C0D0 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trub1Q8C0D0 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trub1Q8C0D0 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trub1Q8C0D0 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trub1Q8C0D0 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trub1Q8C0D0 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trub1Q8C0D0 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trub1Q8C0D0 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trub1Q8C0D0 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trub1Q8C0D0 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trub1Q8C0D0 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trub1Q8C0D0 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trub1Q8C0D0 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trub1Q8C0D0 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trub1Q8C0D0 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trub1Q8C0D0 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trub1Q8C0D0 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trub1Q8C0D0 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trub1Q8C0D0 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trub1Q8C0D0 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trub1Q8C0D0 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trub1Q8C0D0 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trub1Q8C0D0 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trub1Q8C0D0 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trub1Q8C0D0 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trub1Q8C0D0 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trub1Q8C0D0 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trub1Q8C0D0 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trub1Q8C0D0 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trub1Q8C0D0 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trub1Q8C0D0 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trub1Q8C0D0 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trub1Q8C0D0 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trub1Q8C0D0 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trub1Q8C0D0 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trub1Q8C0D0 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trub1Q8C0D0 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trub1Q8C0D0 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trub1Q8C0D0 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trub1Q8C0D0 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trub1Q8C0D0 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trub1Q8C0D0 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trub1Q8C0D0 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trub1Q8C0D0 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trub1Q8C0D0 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trub1Q8C0D0 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trub1Q8C0D0 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trub1Q8C0D0 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trub1Q8C0D0 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trub1Q8C0D0 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trub1Q8C0D0 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trub1Q8C0D0 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trub1Q8C0D0 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trub1Q8C0D0 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trub1Q8C0D0 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trub1Q8C0D0 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trub1Q8C0D0 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trub1Q8C0D0 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trub1Q8C0D0 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trub1Q8C0D0 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trub1Q8C0D0 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trub1Q8C0D0 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trub1Q8C0D0 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trub1Q8C0D0 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trub1Q8C0D0 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trub1Q8C0D0 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trub1Q8C0D0 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trub1Q8C0D0 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trub1Q8C0D0 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trub1Q8C0D0 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trub1Q8C0D0 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trub1Q8C0D0 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms