Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbbp5Q8BX09 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms