Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pggt1bQ8BUY9 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pggt1bQ8BUY9 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pggt1bQ8BUY9 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Pggt1bQ8BUY9 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pggt1bQ8BUY9 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Pggt1bQ8BUY9 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pggt1bQ8BUY9 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pggt1bQ8BUY9 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pggt1bQ8BUY9 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Pggt1bQ8BUY9 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Pggt1bQ8BUY9 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pggt1bQ8BUY9 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Pggt1bQ8BUY9 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pggt1bQ8BUY9 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Pggt1bQ8BUY9 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Pggt1bQ8BUY9 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Pggt1bQ8BUY9 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pggt1bQ8BUY9 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Pggt1bQ8BUY9 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Pggt1bQ8BUY9 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pggt1bQ8BUY9 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pggt1bQ8BUY9 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Pggt1bQ8BUY9 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Pggt1bQ8BUY9 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pggt1bQ8BUY9 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pggt1bQ8BUY9 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Pggt1bQ8BUY9 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pggt1bQ8BUY9 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pggt1bQ8BUY9 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pggt1bQ8BUY9 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pggt1bQ8BUY9 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pggt1bQ8BUY9 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pggt1bQ8BUY9 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Pggt1bQ8BUY9 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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