Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTS4

Nup54, Nuclear pore complex protein Nup54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup54Q8BTS4 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms