Protein–RNA interactions for Protein: Q8BP27

Sfr1, Swi5-dependent recombination DNA repair protein 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfr1Q8BP27 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfr1Q8BP27 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfr1Q8BP27 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfr1Q8BP27 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfr1Q8BP27 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfr1Q8BP27 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfr1Q8BP27 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfr1Q8BP27 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfr1Q8BP27 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfr1Q8BP27 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfr1Q8BP27 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfr1Q8BP27 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfr1Q8BP27 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfr1Q8BP27 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfr1Q8BP27 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfr1Q8BP27 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfr1Q8BP27 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfr1Q8BP27 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfr1Q8BP27 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfr1Q8BP27 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfr1Q8BP27 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfr1Q8BP27 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfr1Q8BP27 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfr1Q8BP27 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfr1Q8BP27 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfr1Q8BP27 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfr1Q8BP27 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfr1Q8BP27 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfr1Q8BP27 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfr1Q8BP27 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfr1Q8BP27 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfr1Q8BP27 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfr1Q8BP27 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfr1Q8BP27 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfr1Q8BP27 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfr1Q8BP27 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfr1Q8BP27 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Sfr1Q8BP27 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfr1Q8BP27 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfr1Q8BP27 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfr1Q8BP27 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfr1Q8BP27 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfr1Q8BP27 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfr1Q8BP27 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfr1Q8BP27 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfr1Q8BP27 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfr1Q8BP27 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfr1Q8BP27 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfr1Q8BP27 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfr1Q8BP27 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfr1Q8BP27 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfr1Q8BP27 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfr1Q8BP27 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfr1Q8BP27 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfr1Q8BP27 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfr1Q8BP27 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfr1Q8BP27 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfr1Q8BP27 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfr1Q8BP27 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfr1Q8BP27 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfr1Q8BP27 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfr1Q8BP27 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfr1Q8BP27 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfr1Q8BP27 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfr1Q8BP27 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Sfr1Q8BP27 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfr1Q8BP27 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfr1Q8BP27 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfr1Q8BP27 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfr1Q8BP27 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfr1Q8BP27 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfr1Q8BP27 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfr1Q8BP27 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfr1Q8BP27 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfr1Q8BP27 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfr1Q8BP27 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfr1Q8BP27 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfr1Q8BP27 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfr1Q8BP27 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfr1Q8BP27 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfr1Q8BP27 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfr1Q8BP27 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfr1Q8BP27 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfr1Q8BP27 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfr1Q8BP27 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfr1Q8BP27 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfr1Q8BP27 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfr1Q8BP27 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfr1Q8BP27 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfr1Q8BP27 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfr1Q8BP27 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfr1Q8BP27 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfr1Q8BP27 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfr1Q8BP27 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sfr1Q8BP27 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sfr1Q8BP27 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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