Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJ71

Nup93, Nuclear pore complex protein Nup93, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 819 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup93Q8BJ71 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nup93Q8BJ71 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nup93Q8BJ71 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nup93Q8BJ71 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nup93Q8BJ71 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nup93Q8BJ71 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nup93Q8BJ71 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nup93Q8BJ71 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nup93Q8BJ71 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nup93Q8BJ71 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nup93Q8BJ71 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nup93Q8BJ71 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nup93Q8BJ71 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nup93Q8BJ71 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nup93Q8BJ71 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nup93Q8BJ71 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nup93Q8BJ71 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms