Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIJ7

Rufy1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy1Q8BIJ7 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms