Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC1

UPF0489 protein C5orf22 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BGC1 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8BGC1 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8BGC1 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8BGC1 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8BGC1 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8BGC1 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8BGC1 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8BGC1 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms