Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
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H2-M10.4Q85ZW8 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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H2-M10.4Q85ZW8 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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H2-M10.4Q85ZW8 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
H2-M10.4Q85ZW8 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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H2-M10.4Q85ZW8 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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H2-M10.4Q85ZW8 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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H2-M10.4Q85ZW8 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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H2-M10.4Q85ZW8 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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