Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc50Q810U5 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc50Q810U5 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc50Q810U5 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc50Q810U5 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc50Q810U5 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc50Q810U5 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc50Q810U5 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc50Q810U5 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc50Q810U5 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc50Q810U5 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc50Q810U5 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc50Q810U5 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc50Q810U5 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc50Q810U5 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc50Q810U5 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc50Q810U5 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc50Q810U5 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc50Q810U5 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc50Q810U5 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc50Q810U5 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc50Q810U5 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc50Q810U5 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc50Q810U5 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc50Q810U5 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc50Q810U5 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc50Q810U5 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc50Q810U5 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc50Q810U5 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc50Q810U5 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc50Q810U5 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc50Q810U5 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc50Q810U5 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc50Q810U5 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc50Q810U5 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc50Q810U5 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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