Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim19Q80ZU4 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim19Q80ZU4 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim19Q80ZU4 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim19Q80ZU4 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim19Q80ZU4 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim19Q80ZU4 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim19Q80ZU4 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim19Q80ZU4 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim19Q80ZU4 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim19Q80ZU4 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim19Q80ZU4 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim19Q80ZU4 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim19Q80ZU4 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim19Q80ZU4 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim19Q80ZU4 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Smim19Q80ZU4 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Smim19Q80ZU4 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Smim19Q80ZU4 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Smim19Q80ZU4 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Smim19Q80ZU4 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Smim19Q80ZU4 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Smim19Q80ZU4 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Smim19Q80ZU4 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Smim19Q80ZU4 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Smim19Q80ZU4 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
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