Protein–RNA interactions for Protein: Q80YS5

Lrrc27, Leucine-rich repeat-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc27Q80YS5 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms