Protein–RNA interactions for Protein: Q80XU8

Lrfn4, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrfn4Q80XU8 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrfn4Q80XU8 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrfn4Q80XU8 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrfn4Q80XU8 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrfn4Q80XU8 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrfn4Q80XU8 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrfn4Q80XU8 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrfn4Q80XU8 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrfn4Q80XU8 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrfn4Q80XU8 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrfn4Q80XU8 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrfn4Q80XU8 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrfn4Q80XU8 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrfn4Q80XU8 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrfn4Q80XU8 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrfn4Q80XU8 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrfn4Q80XU8 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrfn4Q80XU8 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrfn4Q80XU8 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrfn4Q80XU8 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrfn4Q80XU8 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrfn4Q80XU8 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrfn4Q80XU8 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrfn4Q80XU8 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrfn4Q80XU8 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lrfn4Q80XU8 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lrfn4Q80XU8 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lrfn4Q80XU8 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lrfn4Q80XU8 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lrfn4Q80XU8 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lrfn4Q80XU8 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lrfn4Q80XU8 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lrfn4Q80XU8 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lrfn4Q80XU8 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lrfn4Q80XU8 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lrfn4Q80XU8 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lrfn4Q80XU8 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Lrfn4Q80XU8 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lrfn4Q80XU8 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lrfn4Q80XU8 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Lrfn4Q80XU8 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lrfn4Q80XU8 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Lrfn4Q80XU8 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lrfn4Q80XU8 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lrfn4Q80XU8 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lrfn4Q80XU8 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrfn4Q80XU8 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrfn4Q80XU8 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrfn4Q80XU8 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrfn4Q80XU8 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrfn4Q80XU8 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrfn4Q80XU8 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrfn4Q80XU8 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrfn4Q80XU8 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrfn4Q80XU8 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrfn4Q80XU8 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrfn4Q80XU8 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrfn4Q80XU8 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrfn4Q80XU8 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrfn4Q80XU8 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrfn4Q80XU8 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrfn4Q80XU8 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrfn4Q80XU8 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrfn4Q80XU8 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrfn4Q80XU8 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrfn4Q80XU8 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrfn4Q80XU8 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrfn4Q80XU8 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrfn4Q80XU8 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrfn4Q80XU8 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrfn4Q80XU8 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrfn4Q80XU8 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrfn4Q80XU8 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrfn4Q80XU8 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrfn4Q80XU8 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrfn4Q80XU8 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrfn4Q80XU8 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrfn4Q80XU8 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrfn4Q80XU8 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrfn4Q80XU8 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrfn4Q80XU8 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrfn4Q80XU8 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrfn4Q80XU8 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrfn4Q80XU8 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrfn4Q80XU8 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrfn4Q80XU8 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrfn4Q80XU8 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrfn4Q80XU8 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lrfn4Q80XU8 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lrfn4Q80XU8 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lrfn4Q80XU8 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lrfn4Q80XU8 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lrfn4Q80XU8 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lrfn4Q80XU8 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lrfn4Q80XU8 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lrfn4Q80XU8 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lrfn4Q80XU8 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lrfn4Q80XU8 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Lrfn4Q80XU8 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lrfn4Q80XU8 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms