Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms