Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
NischQ80TM9 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
NischQ80TM9 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
NischQ80TM9 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
NischQ80TM9 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
NischQ80TM9 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
NischQ80TM9 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
NischQ80TM9 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
NischQ80TM9 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
NischQ80TM9 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
NischQ80TM9 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
NischQ80TM9 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
NischQ80TM9 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
NischQ80TM9 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
NischQ80TM9 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
NischQ80TM9 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
NischQ80TM9 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
NischQ80TM9 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
NischQ80TM9 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
NischQ80TM9 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
NischQ80TM9 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
NischQ80TM9 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
NischQ80TM9 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
NischQ80TM9 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
NischQ80TM9 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
NischQ80TM9 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
NischQ80TM9 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
NischQ80TM9 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
NischQ80TM9 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
NischQ80TM9 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
NischQ80TM9 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
NischQ80TM9 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC30.52■■■□□ 2.48
NischQ80TM9 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
NischQ80TM9 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
NischQ80TM9 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
NischQ80TM9 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
NischQ80TM9 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
NischQ80TM9 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
NischQ80TM9 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
NischQ80TM9 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC30.52■■■□□ 2.48
NischQ80TM9 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
NischQ80TM9 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
NischQ80TM9 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
NischQ80TM9 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
NischQ80TM9 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
NischQ80TM9 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
NischQ80TM9 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
NischQ80TM9 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
NischQ80TM9 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
NischQ80TM9 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
NischQ80TM9 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
NischQ80TM9 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
NischQ80TM9 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
NischQ80TM9 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
NischQ80TM9 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
NischQ80TM9 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
NischQ80TM9 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
NischQ80TM9 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
NischQ80TM9 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
NischQ80TM9 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
NischQ80TM9 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC30.5■■■□□ 2.47
NischQ80TM9 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
NischQ80TM9 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
NischQ80TM9 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
NischQ80TM9 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
NischQ80TM9 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
NischQ80TM9 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
NischQ80TM9 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
NischQ80TM9 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
NischQ80TM9 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
NischQ80TM9 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
NischQ80TM9 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
NischQ80TM9 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
NischQ80TM9 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
NischQ80TM9 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
NischQ80TM9 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
NischQ80TM9 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
NischQ80TM9 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
NischQ80TM9 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
NischQ80TM9 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
NischQ80TM9 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
NischQ80TM9 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
NischQ80TM9 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
NischQ80TM9 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
NischQ80TM9 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
NischQ80TM9 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
NischQ80TM9 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
NischQ80TM9 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
NischQ80TM9 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
NischQ80TM9 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
NischQ80TM9 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
NischQ80TM9 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
NischQ80TM9 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
NischQ80TM9 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
NischQ80TM9 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
NischQ80TM9 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
NischQ80TM9 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
NischQ80TM9 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
NischQ80TM9 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
NischQ80TM9 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms