Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT28

Rexo1, RNA exonuclease 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo1Q7TT28 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rexo1Q7TT28 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rexo1Q7TT28 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rexo1Q7TT28 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rexo1Q7TT28 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rexo1Q7TT28 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rexo1Q7TT28 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rexo1Q7TT28 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rexo1Q7TT28 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rexo1Q7TT28 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rexo1Q7TT28 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rexo1Q7TT28 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rexo1Q7TT28 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rexo1Q7TT28 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rexo1Q7TT28 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rexo1Q7TT28 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rexo1Q7TT28 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rexo1Q7TT28 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rexo1Q7TT28 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rexo1Q7TT28 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rexo1Q7TT28 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rexo1Q7TT28 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rexo1Q7TT28 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rexo1Q7TT28 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rexo1Q7TT28 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rexo1Q7TT28 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rexo1Q7TT28 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rexo1Q7TT28 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rexo1Q7TT28 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rexo1Q7TT28 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rexo1Q7TT28 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Rexo1Q7TT28 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rexo1Q7TT28 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Rexo1Q7TT28 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rexo1Q7TT28 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rexo1Q7TT28 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rexo1Q7TT28 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rexo1Q7TT28 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rexo1Q7TT28 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rexo1Q7TT28 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms