Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2q1Q7TSS2 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2q1Q7TSS2 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2q1Q7TSS2 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2q1Q7TSS2 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2q1Q7TSS2 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Ube2q1Q7TSS2 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2q1Q7TSS2 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2q1Q7TSS2 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2q1Q7TSS2 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Ube2q1Q7TSS2 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Ube2q1Q7TSS2 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2q1Q7TSS2 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2q1Q7TSS2 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2q1Q7TSS2 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2q1Q7TSS2 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2q1Q7TSS2 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2q1Q7TSS2 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2q1Q7TSS2 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2q1Q7TSS2 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2q1Q7TSS2 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Ube2q1Q7TSS2 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Ube2q1Q7TSS2 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2q1Q7TSS2 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2q1Q7TSS2 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Ube2q1Q7TSS2 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2q1Q7TSS2 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Ube2q1Q7TSS2 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2q1Q7TSS2 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Ube2q1Q7TSS2 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Ube2q1Q7TSS2 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ube2q1Q7TSS2 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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Ube2q1Q7TSS2 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2q1Q7TSS2 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2q1Q7TSS2 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2q1Q7TSS2 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2q1Q7TSS2 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2q1Q7TSS2 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2q1Q7TSS2 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2q1Q7TSS2 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Ube2q1Q7TSS2 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2q1Q7TSS2 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2q1Q7TSS2 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2q1Q7TSS2 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2q1Q7TSS2 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2q1Q7TSS2 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Ube2q1Q7TSS2 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Ube2q1Q7TSS2 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms